1.文字识别误差 同一篇论文用论文查重Word版与PDF对版本进行得到明显的论文重复率差异，这主要是由于文本识别率的差异。同时，由于提交的原因，检测报告中有时会出现乱码PDF由于版本论文或数据库中论文的文本转换错误。
2.转页文字处理错误 当两篇论文共用一页或同一篇论文的排版标志下转到某一页时，检测结果可能会出现被检测论文与其自身重复或同一文本错误，直接导致复制比增加，必须手动识别。
3.外文论文检测水平需要提高和突破 在测试中发现，目前外语论文的测试结果复制相对较低，这与测试系统包含的外语文献基础数据不足和范围有限有关。较低的复制比不能反映论文的真实质量水平。 由此也可以看出，虽然知网检测非常权威，但并非没有发现任何问题中国其他查重软件相比，知网仍然是最专业的。
因此，我们不能因为知网有一些缺陷而认为知网不可信。知网仍然是专业的，值得信赖。
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